Desde a difusão em larga escala do mapeamento auricular na Europa, nos anos 50, quem mais trabalhou na aplicação da técnica foram os profissionais da acupuntura, que já estavam acostumados com as agulhas. Isso contribuiu para que se confundisse as duas técnicas.
Mas as diferenças são grandes. Uma das principais é que enquanto para a acupuntura os pontos existem o tempo todo no corpo, para a auriculoterapia eles não existem a princípio, só vindo a surgir em correspondência a um desequilíbrio no corpo, facilitando ao máximo a avaliação e tornando praticamente impossível de se errar.